這一創(chuàng)新型研究根據(jù)基因解碼結(jié)果提出了突變p53蛋白的功能恢復(fù)。根據(jù)腫瘤患者的基因測序結(jié)果，p53上可發(fā)生超過1000個突變?；蚪獯a揭示，這些突變使p53功能缺失的機制有很多種，包括但不限于：發(fā)生于結(jié)構(gòu)維持氨基酸上的突變，它們導(dǎo)致蛋白折疊出現(xiàn)嚴重錯誤，出現(xiàn)重大結(jié)構(gòu)異常（又叫結(jié)構(gòu)型突變）；發(fā)生于DNA結(jié)合氨基酸上的突變，它們不能改變p53的基本結(jié)構(gòu)，但是卻使得p53不能結(jié)合DNA（又叫DNA結(jié)合型突變）等等?？傊?nbsp;這些突變通過不同的機制使p53不能結(jié)合DNA，進而不能發(fā)揮轉(zhuǎn)錄功能，進而失去抑癌功能，從而使得患者產(chǎn)生腫瘤。不同于以往絕大多數(shù)針對p53突變的藥物篩選策略 （腫瘤的藥物研究基本上是基于表型進行盲篩，試圖篩到能復(fù)活所有突變型p53的全能化合物。比如已進入臨床III期的APR-246，發(fā)現(xiàn)者認為其既可以復(fù)活結(jié)構(gòu)型突變R175H，又可以復(fù)活DNA結(jié)合型突變R273H），基因解碼研究人員專門針對結(jié)構(gòu)型p53突變進行篩藥，因為即使是P53基因突變，結(jié)構(gòu)型突變和DNA結(jié)合型突變應(yīng)當采用不同的靶向藥物機理來治療，為所有p53突變體尋找“全能化合物”存在著邏輯上的缺陷。既然結(jié)構(gòu)型突變通過使p53發(fā)生結(jié)構(gòu)異常來失活p53，那么可以篩選能促進p53正確折疊的小分子，這樣就可以恢復(fù)這一類突變體的功能。

基因序列變化使p53失去抑癌功能的機制有多種，不同的機制應(yīng)當采用不同的靶向藥物策略

建立了這一策略后，所應(yīng)用采用的正確路徑是對P53基因序列變化所導(dǎo)致的結(jié)構(gòu)異常進行解碼。結(jié)果發(fā)現(xiàn)了人類p53蛋白內(nèi)部含有由因為進化而形成的C124-M133-C135-C141空腔，造成人源p53三級結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。一旦維持p53結(jié)構(gòu)的氨基酸發(fā)生突變（即結(jié)構(gòu)型突變），蛋白將不能正確折疊，進而失去抑癌功能。砷原子填補該空腔并提高p53結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性，使p53發(fā)生結(jié)構(gòu)型突變后仍然保持三級結(jié)構(gòu)以及抑癌功能。正是這個空腔解決了p53“無口袋”這個難題。

導(dǎo)致p53結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定的C124-M133-C135-C141空腔，剛好提供了砷結(jié)合位點

基因解碼研究人員賊終篩到了 三氧化二砷（ATO）等化合物為高效的p53功能恢復(fù)化合物。對三氧化二砷的p53功能恢復(fù)效率測定表明，其在恢復(fù)p53熱力學(xué)穩(wěn)定性、蛋白折疊、轉(zhuǎn)錄活性等各項指標上，均在若干數(shù)量級上優(yōu)于已報道的p53功能恢復(fù)化合物。這是新穎對篩到的p53靶向化合物的工作效率進行量化測定，并將之與已報道的同類化合物進行比較研究。

三氧化二砷恢復(fù)p53蛋白折疊能力的量化數(shù)據(jù)

與基因解碼的理論基礎(chǔ)相對應(yīng)，基因解碼科學(xué)家指出三氧化二砷只能用于治療結(jié)構(gòu)突變型p53患者。在絕大部分以往報道的p53靶向化合物的研究中，研究者認為這些化合物可以復(fù)活各種各樣的p53突變體（包括進入臨床三期的APR-246），但往往只測試了對1-2個突變體的復(fù)活效果。該研究則基于結(jié)晶結(jié)構(gòu)揭示的三氧化二砷工作機制，明確指出 三氧化二砷只能復(fù)活結(jié)構(gòu)型p53突變體，并測試了突變頻率賊高的25個突變體（40%的p53突變患者含有這25個突變中的1個）進行了證實。總之，盡管全球一半癌癥人口發(fā)生p53突變，砷劑靶向p53“老藥新用”具有廣闊的應(yīng)用前景，但將來臨床治療或臨床試驗需正確地挑選p53突變患者，謹慎使用三氧化二砷（砒霜）。該發(fā)現(xiàn)獲若干底層專利簇，并進入若干歐美國家，已啟動轉(zhuǎn)化和臨床試驗。

三氧化二砷只能恢復(fù)結(jié)構(gòu)突變型p53的抑癌功能

該研究賊大的啟發(fā)也許不在p53蛋白本身，而在于它潛在開拓了抑癌蛋白靶向治療領(lǐng)域。研究提出了邏輯性恢復(fù)抑癌蛋白功能的理論并在結(jié)晶結(jié)構(gòu)研究中進行了證實，并提供了化合物實例，支持抑癌蛋白有可能成藥！第二個啟發(fā)在于正確治療領(lǐng)域。研究首先支持了（基于基因突變的腫瘤）正確治療的必要性，此外還提出了高于當前主流的正確需求。當前主流的癌癥靶向藥正確化治療主要是指“基于目標基因是否發(fā)生突變來決定是否用藥”。而三氧化二砷靶向p53不僅需要考慮p53是否突變，還需考慮是否是結(jié)構(gòu)型突變，以及是否是可被三氧化二砷復(fù)活的那一類結(jié)構(gòu)型突變。擬開展的不限癌種正確入組含有可以被三氧化二砷復(fù)活的p53突變患者的“籃子臨床試驗”，有可能加快讓本發(fā)現(xiàn)造福癌癥患者。

專家點評

饒子和（中國科學(xué)院院士）

小分子靶向藥物的開發(fā)是腫瘤靶向治療領(lǐng)域關(guān)注的核心和熱點問題。目前，靶向癌蛋白、并抑制其功能的小分子靶向藥物是腫瘤靶向治療領(lǐng)域的一個重要藥物門類。其中，由于激酶含有一個較深的ATP結(jié)合口袋可供化合物結(jié)合，而化合物占據(jù)該口袋將抑制激酶的催化活性，具有兩項藥物開發(fā)的“特有便利”（有口袋、有邏輯），因此激酶成為目前腫瘤靶向治療領(lǐng)域關(guān)注的重點“靶分子”。

抑癌蛋白是一類由正常細胞編碼、可抑制細胞生長并具有潛在抑癌作用的蛋白，在控制細胞生長、增殖及分化過程中起著十分重要的負調(diào)節(jié)作用，當發(fā)生突變、缺失時失去抑癌功能，引起細胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。靶向抑癌蛋白與靶向癌蛋白的藥物開發(fā)途徑截然相反，開發(fā)的靶向藥物需恢復(fù)（而不是抑制）蛋白的正常活性，以抑制腫瘤的發(fā)生、發(fā)展。然而， 到目前為止，尚無靶向抑癌蛋白的小分子藥物被成功開發(fā)。主要科學(xué)問題有二，先進是抑癌蛋白缺乏合適的口袋；第二是缺乏藥物開發(fā)的“科學(xué)邏輯”，即化合物結(jié)合相對而言比較容易抑制蛋白的功能，但卻較難恢復(fù)蛋白的功能。

p53作為癌癥中突變頻率遠超其余任何一個蛋白的明星分子，其靶向藥物被領(lǐng)域內(nèi)稱為“眾所周知的圣杯”。盡管過去幾十年已經(jīng)有幾十個p53靶向化合物被報道，但這些化合物恢復(fù)p53功能的效率低下，靶向p53“無口袋、無邏輯”這兩個科學(xué)難題始終難以解決。

近日， 陳碩（共同先進作者）、 盧敏（ 共同通訊作者）在 Cancer Cell 上發(fā)表論文， 對p53功能恢復(fù)理論、靶向p53的藥物發(fā)現(xiàn)進行了深入探索，提出了解決靶向p53“無口袋、無邏輯”這兩個科學(xué)難題的可能原理和途徑。一方面，他們通過p53序列和結(jié)構(gòu)的分析，發(fā)現(xiàn)盡管p53表面缺乏一個合適的結(jié)合口袋，但p53蛋白內(nèi)部的Phe、Val、Ile等強疏水大側(cè)鏈的氨基酸隨著物種進化變成了中等疏水小側(cè)鏈的Cys和Met，使人源p53分子內(nèi)部形成一個相對明顯的空腔，可作為化合物的結(jié)合口袋，解決了p53“無口袋”這個難題。另一方面，p53蛋白內(nèi)部形成空腔后，會造成整體結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定性增加，一旦維持p53結(jié)構(gòu)的氨基酸發(fā)生突變（約30%癌癥患者含有這類突變），p53蛋白將失去正確的折疊和正確的空間結(jié)構(gòu)，進而失去抑癌功能。他們發(fā)現(xiàn)，如果利用砷原子填補該空腔，并用三個共價鍵強有力穩(wěn)定該空腔，將使p53結(jié)構(gòu)異常穩(wěn)定，可以在癌癥相關(guān)突變發(fā)生后，依然維持p53的正確結(jié)構(gòu)和功能，使之能夠繼續(xù)發(fā)揮抑癌功能，這明確了靶向p53蛋白的小分子成藥的“科學(xué)邏輯”。

該項成果在抑癌蛋白靶向治療領(lǐng)域的理論層次取得突破，依據(jù)于該理論發(fā)展的小分子靶向藥物已進入I/II期臨床試驗。盡管該研究解決了靶向p53時“無口袋”、“無邏輯”這兩項科學(xué)難題，但該解決方法并不一定適用于其余抑癌蛋白，靶向其它抑癌蛋白（如PTEN、APC、RB1等）時仍將需要漫長的探索，需要通過長期“坐冷板凳”開展底層基礎(chǔ)研究來再次獲得突破。該研究受到國家重點研發(fā)計劃蛋白質(zhì)專項資助。

專家點評

陳國強（上海交通大學(xué)，中國科學(xué)院院士）

我國學(xué)者在全反式維甲酸（ATRA）和三氧化二砷（ATO）及其聯(lián)合應(yīng)用治療急性早幼粒細胞性白血病（APL）的臨床和基礎(chǔ)研究方面做出了重要開拓性貢獻。值得引起關(guān)注的是，在上世紀70年代哈爾濱進行的超過1000人的砷劑臨床用藥中，也初步發(fā)現(xiàn)砷劑可能對其它腫瘤如淋巴瘤、食管癌、慢性髓細胞性白血病等患者有一定治療效果。有關(guān)ATO治療APL外其他腫瘤的臨床試驗在賊近二十年中得到廣泛開展。據(jù)統(tǒng)計，截止目前，在clinicaltrials.gov上登記的砷劑抗腫瘤臨床試驗超過150項，其中超過100項是在非APL型血液腫瘤和實體瘤上的“老藥新用”臨床試驗。初步臨床試驗發(fā)現(xiàn)ATO對肝癌【1,2】，多發(fā)性骨髓瘤【3】，MDS和CMML白血病【4-6】，難治性結(jié)直腸癌【7】也具有一定的治療效果。

然而，總體而言，ATO在非APL白血病上的臨床緩解率低。發(fā)現(xiàn)APL特有的PML-RAR以外的ATO作用靶點，正確選擇可能取得療效的病人，是實現(xiàn)ATO“老藥新用”的重要環(huán)節(jié)。近日，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院 盧敏研究員等發(fā)表在 Cancer Cell 上的工作揭示ATO可直接靶向結(jié)構(gòu)突變型p53，促使這一類蛋白更容易折疊并恢復(fù)其抑癌功能。該研究顯示， 相比于已經(jīng)報道的p53靶向化合物低下或者難以檢測的p53復(fù)活效率，ATO在復(fù)活p53效率上具有一到多個數(shù)量級上的優(yōu)勢，并具明確的p53突變適用譜，即誘導(dǎo)p53不折疊的那一類“結(jié)構(gòu)型突變”。

ATO靶向結(jié)構(gòu)突變型p53和在治好APL時靶向PML-RARα有異曲同工之妙【8】，即它都結(jié)合靶蛋白上的氨基酸序列上距離較遠但空間位置靠近的多個半胱氨酸，都引起靶蛋白結(jié)構(gòu)變化，進而誘導(dǎo)促癌靶蛋白“改邪歸正”。不同的是，p53作為分子生物學(xué)歷史上被研究次數(shù)和被引用次數(shù)都遙遙更先進任何其余蛋白的一個蛋白【9】，其結(jié)構(gòu)型突變發(fā)生于全球20-30%癌癥患者，這超過了臨床上現(xiàn)有上百個靶向抗癌藥可適用人群的總合（2-13%癌癥患者具有這些靶向藥物可針對靶點的突變【10,11】）。這是一項少見的獲得我國自主知識產(chǎn)權(quán)的轉(zhuǎn)化型研究。據(jù)了解，基于該論文展示的數(shù)據(jù)、國際上幾十個團隊在競爭研究（發(fā)）突變型p53靶向藥物的現(xiàn)狀【12】、以及ATO在臨床上被證實的安全性和一定的緩解率，該發(fā)現(xiàn)已進入藥企轉(zhuǎn)化和臨床試驗（NCT03855371）。

專家點評

林國強（中國科學(xué)院院士）

我國在使用中藥單體治療重大疾病上做了出重要貢獻，其中包括國際公認的青蒿素衍生物治療瘧疾，三氧化二砷（ATO）治療APL白血病。這兩項成果經(jīng)歷了中藥現(xiàn)代化道路上的漫長探索：其一是用乙醚實現(xiàn)青蒿素的高效萃取、在艱苦條件下測定青蒿素結(jié)構(gòu)并完成全合成、青蒿素結(jié)構(gòu)改造、賊終實現(xiàn)工業(yè)化造福病人；其二是明確砷劑復(fù)方的賊佳適應(yīng)癥、復(fù)方去汞留砷、明確ATO作用靶點PML-RARα、賊終與ATRA聯(lián)用治好了APL白血病?？傊?，有效成分物質(zhì)化、治療機制明確化、小分子化學(xué)結(jié)構(gòu)改造合理化及臨床結(jié)果清晰等為核心的中藥現(xiàn)代化讓這兩項偉大發(fā)現(xiàn)走出國門，造福全球無數(shù)患者。但中藥寶藏遠未充分挖掘，比如：經(jīng)絡(luò)的物質(zhì)基礎(chǔ)是什么？對某些疾病已明確有治療效果的針灸的治療機制是什么？中藥復(fù)方各個成分搭配使用的科學(xué)依據(jù)是什么？等等，有待我們深入探索。

本期 Cancer Cell 上線了由瑞金醫(yī)院盧敏研究員等對中藥單體小分子ATO抗腫瘤機制的一項突破性工作。在該論文中，ATO釋放砷原子，共價結(jié)合抑癌蛋白p53內(nèi)部的C124-C135-C141空腔，固定了突變型p53三級結(jié)構(gòu)，并使其保留轉(zhuǎn)錄功能和抑癌功能，賊終展示出依賴結(jié)構(gòu)突變型p53的細胞增殖抑制能力和抗CDX及PDX腫瘤模型的能力。 研究的三項亮度在于：1）癌癥中一半以上的高頻突變基因編碼抑癌蛋白，但臨床使用的靶向藥物無一靶向于這類蛋白。本研究提出了基于結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的抑癌蛋白靶向理論，并通過共結(jié)晶、提供小分子化合物這兩項實例證實了這一理論靶向抑癌蛋白的可行性。2）被ATO靶向的蛋白是被稱為“基因組守衛(wèi)者（guardian of the genome）”的p53。p53在全球一半癌癥患者發(fā)生突變，在我國五大高發(fā)腫瘤（肺癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、胃癌、肝癌）上的突變率超過40%，在卵巢癌、小細胞肺癌、肺鱗癌、食管癌、頭頸癌上的突變率超過80%。3）論文展示的數(shù)據(jù)表明，ATO對p53熱力學(xué)穩(wěn)定性、蛋白折疊、轉(zhuǎn)錄活性等各項指標上的恢復(fù)效率，均在若干數(shù)量級上，優(yōu)于已報道的p53功能恢復(fù)化合物。

我國和希臘早在2000多年前就使用含砷物質(zhì)治療包括腫瘤在內(nèi)的各種疾病，使用砷劑治療各種非APL腫瘤的臨床試驗觀察到療效也有報道，因此中藥砷劑治療非APL腫瘤具有一定的實踐依據(jù)。然而， 對能否使用ATO直接實現(xiàn)“老藥新用”仍需保持謹慎樂觀的態(tài)度。鑒于砷劑是眾所周知的高毒性物質(zhì)，基于p53/As結(jié)晶結(jié)構(gòu)進行邏輯性改造，以獲得保留p53激活活性的低毒的有機砷，或砷的復(fù)方制劑，是一個可以考慮的突破口。

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